1578年，年仅49岁的上杉谦信突然中风去世，而因上杉谦信自身无子，并且生前并未明确自己的继承人。其两个养子上杉景胜与上杉景虎之间爆发了争夺上杉谦信继承权的御馆之乱。上杉氏家臣也各自站队，分化为景胜与景虎两方。而本庄繁长则选择加入上杉景胜一方、并令自己的长子本庄显长加入上杉景虎一方。类似如此父子、兄弟分侍敌对双方的情况无论是在中外历史上都十分常见。较为有名的就是三国时期诸葛氏分侍魏蜀吴三家。而在日本战国的关原合战中，例如真田父子分别加入西军与东军的事件也十分普遍。大家族们常常通过这种看似狡诈的手段保持自己家族的延续。
上杉谦信识破武田信玄之计，成功率领全军对山下的武田信玄军展开突击。武田军一度陷入劣势，而血气方刚的信玄长子武田义信竟然对上杉本阵发起反冲锋。惊慌失措的上杉本阵一时陷入混乱，上杉谦信自身处于危险之中。所幸本庄繁长与长尾藤景援军赶来，武田义信队才被迫撤退。然而本庄繁长与长尾藤景二人却不懂君臣之道，时常在背后鼓吹自己救援领主上杉谦信的功劳，使得上杉谦信颜面尽失。上杉谦信怒火中烧，率先诛杀了长尾藤景。而本庄繁长亦唇亡齿寒，害怕同样的命运降临于自己身上。不得已才暗通武田信玄造反。而本庄繁长之乱也给上杉谦信带来了不少麻烦。1568年，武田信玄决定与德川家康联手侵入今川家。为防止上杉谦信从自己身后出兵侵略北信浓。武田信玄成功唆使本庄繁长反叛。同时武田信玄还成功唆使越中一揆势力配合本庄繁长，出羽的大宝寺家也加入到本庄繁长一边。甚至伊达、芦名等势力也在背后观望。面对如此窘境，上杉谦信自然管不了武田信玄一方，马上令柿崎景家等人前往其周边戒严，防止本庄繁长展开行动。之后上杉谦信又命直江实纲调略大宝寺家，大宝寺家背叛本庄繁长，转而与上杉氏一同进攻本庄繁长。而武田信玄也没有展开明显行动，仅仅提供了一些兵粮援助。次年，孤立无援的本庄繁长迫不得已投降上杉谦信，并往春日山城交出人质，本庄繁长之乱就此结束。虽然此次叛乱中本庄繁长侥幸得以身免，但其名誉、声望扫地。作为上杉氏的叛将，直到谦信去世，都无法抬起头来。所谓“天无绝人之路”，在本庄繁长最为绝望的时候，上帝却为其开了一扇窗-御馆之乱爆发。
1578年，年仅49岁的上杉谦信突然中风去世，而因上杉谦信自身无子，并且生前并未明确自己的继承人。其两个养子上杉景胜与上杉景虎之间爆发了争夺上杉谦信继承权的御馆之乱。上杉氏家臣也各自站队，分化为景胜与景虎两方。而本庄繁长则选择加入上杉景胜一方、并令自己的长子本庄显长加入上杉景虎一方。类似如此父子、兄弟分侍敌对双方的情况无论是在中外历史上都十分常见。较为有名的就是三国时期诸葛氏分侍魏蜀吴三家。而在日本战国的关原合战中，例如真田父子分别加入西军与东军的事件也十分普遍。大家族们常常通过这种看似狡诈的手段保持自己家族的延续。